（一）沙门氏菌
首选：磺胺类、氯霉素类。 氟苯尼考 20~30 毫克/千克。 或氨苄西林联合氨基糖苷类。
次选：头孢、林可、喹诺酮、氨基糖苷类。氨基糖苷类对蛋壳喷雾， 可降低传播。
0.04%~0.08% 庆大霉素浸泡种蛋。研究表明， 抗生素预防性治疗可以减少沙门氏菌在肠道中定植。
（二）大肠杆菌
首选：第二、三代头孢菌素联合氨基糖苷类 （参考药敏试验可以单用）。
替代：氟喹诺酮类、磺胺、β 内酰胺类/β 内酰胺酶抑制剂。安普霉素幼雏有吸收， 需要考虑毒性。 250~500 毫克/升， 使用 1周。新 霉 素 50~75 毫 克/升 ， 大 观500~1000 毫克/升 ， 庆大霉素 5.0~7.5 毫克/千克等氨基糖苷类可降低雏鸡出现菌血症。黏杆+维生素 E———败血症。莫能菌素可以减少大肠杆菌定植。
头孢噻呋：第三代兽医专用。 粒细胞和血小板减少，腹泻。 小鸡皮下注射 10~20 毫克/千克。
（三）支原体
首选： 泰妙菌素 0.025%、125~250 毫克/升。 四环素类（耐药很低）、替米考星、红霉素（耐药率很高）500毫克/升， 泰乐菌素 10 毫克/千克或100~200 毫克/升。
替代方案：喹诺酮类恩诺沙星、四环素类多西环素 100~200ppm 或15~25 毫克/千克、林可大观霉素。土霉素，300ppm 预防。 金霉素1%混饲———蛋鸡。
10 毫 克 /千 克 或 50 ~75 毫 克/升，恩诺沙星连续 2 周，换 600ppm土霉素，转阴。
药 物 不 能 阻 止 支 原 体 经 蛋 传播。
预防措施：抗生素浸蛋有效，但是需要考虑污染。
升温孵化+抗生素浸泡有效，但是会导致孵化受一定影响。
（四）厌氧菌（梭菌）
首选：青霉素联合甲硝唑、林可霉素、β 内酰胺类/β 内酰胺酶抑制剂如氨苄西林。 20~40 毫克/千克，实际 1.65 克/升 5~10 天，口服饮水，吸收差、代谢快。
替代：阿莫西林、土霉素、泰乐菌素 0.025%、青霉素。磺胺无效。
需要考虑毒素以及活血，黏杆。阿 莫 西 林 血 药 浓 度 高 于 氨 苄1.5~3 倍，但是对菌群有影响导致二重感染，抗生素相关性腹泻。10 毫克/千克，8 小时一次。其他25 毫克/千克体重。
（五）鼻炎
首选：磺胺类。
次选：四环素类、大环内酯类
产蛋鸡用药是一个难点。
次优选择：土霉素、泰妙菌素、林可大观霉素。
建议中西医结合，辛荑散加减。
（六）浆膜炎
首选：磺胺，氯霉素类。
次选：氨基糖苷类、喹诺酮、林可霉素。
磺胺二甲：0.20%~0.25%拌料0.022%林可霉素， 耐药性较多需要联合应用。 常见林可大观霉素。恩诺 50 毫克/千克。头孢噻呋，2 毫克/千克。多西环素耐药严重。
（七）真菌
首选：制霉菌素、氟康唑、酵母菌（新型隐球菌）、酵母样菌（念珠菌属） 和组织胞浆菌大多对氟康唑敏感。 两性霉素 B 抗菌谱最广，活性最强，但不良反应重，当感染严重或上述药物无效时可选用。
替代： *** 铜 1∶2000、苦参、蛇床子。
鸡蛋中残留量 *** 规定
氨苯砷酸：50 微克/千克；
杆菌肽：500 微克/千克；
红霉素：50 微克/千克；
林可霉素：50 微克/千克；
新霉素：500 微克/千克；
土霉素/四环素/金霉素：400 微克/千克。按照 500ppm 停药两周 200微克左右，需要警惕；
大观霉素：2000 微克/千克；
泰妙菌素：1000 微克/千克；
泰乐菌素：300 微克/千 克 ，500毫克/升，连续 3 天，停药后一周更大5 微克。
泰万菌素：200 微克/千克；
喹诺酮、氟苯尼考、青霉素类含头孢存在残留累积。 如环丙停药两周大于停药 3 天的残留量。