1.鸡新城疫速发型嗜内脏型新城疫腺胃出血、扁桃体出血，法氏囊也出血、坏死，但此病死亡率高，肠道有溃疡，有呼吸道和神经症状等，可以区别开。
2.鸡住白细胞原虫病除胸、腿部肌肉出血外，肌肉上有小白色结节，肝脏出血，嗉囊内有血液，血液检查可见到裂殖体或配子体。
3.磺胺类药物中毒胸肌、腿部肌肉出血，肾苍白肿大，有磺胺结晶，有使用磺胺类药物史，停喂磺胺药后病情好转和停息。
4.马立克氏病和淋巴白血病患这两种病时法氏囊也可能肿大或缩小，但还有典型的神经症状和病变及剖检时内脏器官的肿瘤结节。
5.传染性支气管炎要注意与肾型传染性支气管炎引起的肾脏病变相区别。
防治
1.加强饲养管理及卫生措施加强鸡群的饲养管理，保持进雏时间的间隔，做到鸡舍消毒后2~4周后方可进雏，实行全进全出的饲养制，做好清洁卫生及消毒工作，减少和避免各种应激因素等，这些防制传染病的一般原则，对 %防制传染性法氏囊炎是十分重要的。
2.免疫接种通过有效的免疫接种，使鸡群获得特异性抵抗力，这是防制传染性法氏囊炎的最重要的措施。
(1)提高种鸡的抗体水平。种鸡除了在雏鸡阶段进行中等毒力的活疫苗免疫以外，为了提高子代雏鸡的母源抗体水平，还应在18~20周龄和40~42周龄时各进行一 次传染性法氏囊炎油乳剂灭活苗的免疫。
(2)雏鸡的免疫。要根据雏鸡的母源抗体水平确定雏鸡的首免时间。雏鸡出壳后每间隔3天用琼脂扩散法或酶标法测定雏鸡的母源抗体，当鸡群的琼脂扩散法阳性率达到30% ~ 50%或酶标的平均OD值达到3 000~3 500时，对雏鸡进行首免；首免后7~10天进行二免。如果没有检测条件，可采用12~14日龄进行首免，20~24日龄进行二免。所用的疫苗为中等毒力疫苗。
3.发病鸡群的防治
(1)加强饲养管理。适当降低饲料中的蛋白含量(降低到15%左右)，提高维生素的含量。适当提高鸡舍的温度，饮水中加5%的糖或补液盐，减少各种应激。
(2)对鸡舍和养鸡环境进行严格的消毒，有机碘制剂、含氯制剂或福尔马林对此病病毒有较强的杀灭作用。
(3)发病早期用传染性法氏囊炎高免血清或高免蛋黄匀浆及时注射，有较好的防治作用。当有细菌病混合感染时，要投服对症的抗生素控制继发感染。
