PRDC的原发性病原复杂，既有病毒性病原，也有细菌性病原，经常是并发感染，常见的病原主要有：
（1）MH。不同品种、年龄的猪均能感染，尤以哺乳仔猪及幼龄猪最易感染，其次是妊娠后期及哺乳母猪，成年猪多呈慢性或隐性感染。以咳嗽、气喘为特征。MH主要破坏支气管纤毛系统，致使病猪不能有效阻止气源性病原进入呼吸道和肺部，极易诱发其他病原引起的呼吸道疾病。MH可促进PRRSV感染，并加重感染程度，延长PRRSV感染的时间。约45%的PRDC病例中可以检测到MH。MH是PRDC的头号杀手。
（2）PRRSV。病猪的传染性强，感染后PRRSV会存在于尿、唾液和 *** 中。该病毒主要侵害和破坏肺巨噬细胞和单核淋巴结细胞，使得病猪免疫功能下降和免疫抑制，对其他病原的抵抗力减弱，极易继发疾病，抑制其他疫苗的免疫效价。约40%的PRDC病例是由PRRSV引发的。
（3）SIV。猪流感（SI）是猪的一种急性、传染性呼吸器官疾病。其特征为突发，咳嗽，呼吸困难，发热及迅速转归。SI由甲型流感病毒引发，通常暴发于猪之间，传染性很高，但通常不会引发死亡。秋冬季属高发期，全年可传播。病理变化主要在呼吸器官，鼻、咽、喉、气管和支气管的黏膜充血、肿胀，屏障功能被破坏。约有25%PRDC病例由SIV引起。
（4）猪胸膜肺炎放线杆菌（APP）。主要通过呼吸道传染，急性病例体温可升至42℃以上，精神沉郁，呼吸急促，自鼻口流出泡沫样分泌物，耐过者体温不高，呈间歇性咳嗽，生长迟缓。病变多见于肺部，多为两侧性，病变部呈暗红色，界限清晰，硬度增加，切面似肝，间质充满血色胶冻样液体。约有10%的PRDC病例由APP引起。
（5）其他原发性病原。引起PRDC的原发性病原除了上述几种病原外，还有PCV、猪呼吸道冠状病毒（PRCV）、伪狂犬病毒（PRV）、败血性波氏杆菌（Bb）等，这些原发性病原可以单一致病，也可以与其他病原混合感染。
2.1.2 继发性病原
猪感染了原发病原后，体质下降，免疫机能受到抑制，抵抗能力减弱而继发、并发各种疾病，加重了疾病的严重程度。最常见的继发病原如下：
（1）多杀性巴氏杆菌（PM）。临床上一般分为最急性、急性和慢性。最急性表现为突然发病，迅速死亡。急性型，体温升高，初发生痉挛性干咳、呼吸困难、鼻流黏稠液有时混有血液，后变为湿咳，咳时感痛，触诊胸部有剧烈的疼痛。慢性型，有时有持续性咳嗽与呼吸困难，鼻流少许黏稠性分泌物。55%的PRDC病例可以检测到PM。
（2）链球菌。猪链球菌病是由多种不同群的致病性链球菌引起的一种人畜共患的急性、 热性传染病，是一种多型性疾病，主要表现为急性出血性败血症、心内膜炎、脑膜炎、关节炎、哺乳仔猪下痢和孕猪流产等。呼吸道是本病的主要传播途径，消化道、皮肤伤口也可传播。呼吸系统受损伤时，常见鼻腔中流出浆液性或脓性分泌物，呼吸急促，间有咳嗽。常与附红细胞体病、副猪嗜血杆菌、猪瘟、水肿病、毛首线虫等疾病发生混合感染或继发感染。20%以上的PRDC病例中有猪链球菌合并感染。
（3）其他继发性病原。引起PRDC的继发性病原还有副猪嗜血杆菌、弓形体、附红细胞体等。
