与任何其他动物一样，小猫会遭受许多不同的疾病和畸形。一些疾病，如肥厚型心肌病，是先天性的。然而，大多数是通过病毒、感染或寄生虫感染的。幸运的是，接种疫苗的小猫可以免受许多最致命的疾病的侵害。
野猫妈妈（有时称为王后）比家猫更容易生出有健康问题的小猫。这件事情是由很多原因导致的：
- 野猫的小猫可能比它们照顾的要多；
- 野生动物更容易携带可能导致疾病的寄生虫；
- 野生动物经常营养不良，无法为小猫提供适当的营养。
泛白细胞减少症（猫瘟）
正如它通常所说的那样，是细小病毒群中一种特别致命的病毒，经常在野猫群落或任何其他大型猫群聚集的地方发现。它会破坏骨髓以及肠道内的细胞，从而导致危及生命的脱水和败血症。
上呼吸道感染
上呼吸道感染包括鼻气管炎，又称猫疱疹病毒和 猫杯状病毒。这两种病毒都有核心疫苗。这些病毒可引起打喷嚏、流鼻涕和结膜炎（通常称为红眼病）。
第三种传染病是衣原体，它是细菌性的，可以用抗生素治疗，例如四环素。这与人类感染的性传播感染不同类型的衣原体；然而，衣原体可引起结膜炎，并可能传播给人类。
褪色小猫综合症 (FKS)
FKS是一组症状而非单一疾病，是新生小猫死亡的别称。怀孕猫及其小猫的寄养人对这些症状非常熟悉，这些症状可能在出生后不久出现，或者最迟在几周大时出现。 没有已知的单一原因。然而，母猫受损的健康无疑是沉重的负担。
猫免疫缺陷病毒 (FIV)
FIV 通过深咬伤（唾液到血液）或在妊娠或分娩期间（血液到血液）传播；由于免疫系统受损，猫更有可能死于继发感染或其他原因。 由于人类对这种疾病的误解，幸存下来的小猫可能很难被安置在永久的家中。然而，许多猫在生病之前可能会正常生活多年。
猫白血病病毒 (FeLV)
FeLV 具有极强的传染性，可以通过日常接触传播，例如共享食物盘，也可以通过母猫传播。疫苗可以预防 FeLV。然而，一旦出现，它就无法治愈，在某些情况下它可能会潜伏并导致测试变为阴性。潜伏感染的小猫不会生病；但是，感染可能会重新激活。FeLV 抑制免疫系统，使猫死于它们本来可以抵抗的疾病。
耳聋
有些小猫出生时没有听力。这种情况虽然无法治愈，但不会使猫丧失能力。两只蓝眼睛的白猫通常但并非总是天生耳聋。
猫传染性腹膜炎（FIP）
虽然 FIP 通常可以在有大量猫的地区发现，但也可以在具有遗传倾向的小猫中发现。 虽然暴露于导致它的冠状病毒很普遍，但实际上很少有受感染的猫得到 FIP，因为病毒需要变异才能引起疾病。缺点是一旦感染，这种疾病是致命的。
髋关节发育不良
髋关节发育不良被认为是一种遗传疾病，尽管它并不总是立即出现。与狗相比，猫很少见，而且在许多情况下，这种畸形可以通过手术矫正。
猫小脑发育不全（FCH）
FCH 通常由猫瘟热引起，在出生后立即（一到两周）或在妊娠期间收缩。由于它以大脑为中心，CH 是一种神经系统疾病，通常会影响运动技能，包括行走和控制头部的能力。
肥厚型心肌病
某些品种的猫比其他品种更容易患肥厚型心肌病 (HCM)。它们包括 缅因猫、布偶猫和斯芬克斯猫，以及其他品种。虽然通常存在遗传倾向，但它通常不会影响猫，直到它们中年或更老。
多囊肾病 (PKD)
多囊肾病最常见于波斯猫和相关品种。这是一种影响肾脏的进行性遗传疾病，通常要到晚年才被诊断出来。尽职尽责的育种者现在正在测试他们的育种皇后，以努力将 PKD 基因排除在他们的行列之外。
跳蚤传播疾病
几种寄生虫对小猫来说是危险疾病的携带者。普通跳蚤、蜱虫和蚊子可以传播多种疾病：
血巴尔通体
Hemobartonella，又名 hemobartonellosis，是一种红细胞寄生虫，可导致贫血。它可能是致命的（特别是在小猫身上），受感染的猫甚至可能需要输血作为治疗的一部分。
贫血
即使小猫没有从跳蚤中感染血巴尔通体，跳蚤在一段时间内以小猫的血液为食的行为也可能导致不同类型的严重贫血。
绦虫
兽医几乎总是会为绦虫治疗跳蚤出没的小猫。但是，您可能会被要求在预约时间带上小猫的粪便样本，因为它们也容易感染其他寄生虫，例如蛔虫。
