导读：
为了科学准确地划分现有 *** 保种群体的亲缘关系及家系结构，黑龙江省农业科学院畜牧研究所地方猪资源保护与利用团队，对来自地方保种场的70头 *** ，使用“中芯一号”进行了基因型检测，梳理了场内的公猪血统，从多个角度剖析了保种群体的遗传多样性。
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项目背景
*** 是我国华北型猪种的典型代表，具有高繁殖力、耐粗饲、抗寒、肉质优良等种质特性，但也存在生长速度慢、瘦肉率低、料肉比低等问题。在国外商品猪种大量引入我国之前， *** 一直是东北地区的当家品种。由于国外商品猪种生长速度快、饲料报酬高、瘦肉率高，,使 *** 养殖受到冲击，数量锐减。为保护 *** 地方种质资源，黑龙江省农业科学院刘娣研究员团队依托康普森对 *** 进行了保种分析工作，通过更为准确的检测手段对现有群体进行血统划分，为后续的保护利用提供理论支持。同时利用“中芯一号”基因芯片从分子遗传角度解析遗传多样性、亲缘关系、家系结构，通过因果位点分析辅助育种，剔除有害基因型个体，提升种群的生产性能。
利用“中芯一号”基因芯片进行家系梳理
利用“中芯一号”芯片对 *** 的保种群体进行家系梳理，结果表明， *** 保种群内的20头公猪可划分为5个血统，49头母猪可划分到这5个血统，但有1头个体与这5个血统均无亲缘关系，把它归到“其他”类。通过家系构建，从基因层面上将保种场的家系梳理清楚，同时可以科学的指导配种工作，避免近交衰退及场内血统的流失。
利用“中芯一号”基因芯片计算近交系数
基于ROH计算的基因组近交系数是个体真实的近交系数，它比传统系谱计算的期望近交系数更加准确，而且不再依赖于系谱记录的准确性和完整性，能准确反馈两个配子间的关系。该 *** 保种群体的平均近交系数是0.11，属于中度近交，虽然未达到警戒值，但因群体数量较少，在后续扩繁过程中也要优先选择亲缘关系较远的公母个体进行交配，防止近交系数快速上升。
利用“中芯一号”基因芯片因果位点辅助育种
在因果突变分析中，通过对影响猪的肉质性状、生长和体型性状、繁殖性状及抗病性状等11个基因进行基因型分析，结果表明该群体内氟烷基因和酸肉基因还未得到净化；采食量、抗仔猪腹泻和料肉比的优势等位基因占比较高，但影响多肋骨数和多胸椎数的优势等位基因占比非常低，还有较大的选择空间。通过因果位点分析辅助育种，可以有效剔除有害基因型个体，选留优势基因型个体，提升种群的生产性能。
康普森保种分析业务
保种分析可以解析保种群体的遗传多样性，展示群体的亲缘关系和群体近交情况，梳理保种群体的血统情况，从而进行科学的保种工作。
参考文献
[1]张冬杰,何鑫淼,田明,等. *** 保种群体的遗传基础分析[J].黑龙江畜牧兽医,2022(3):5.
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