氨基酸是一种有机分子，由一个氨基基团、一个羧基基团和一个侧链基团组成。氨基酸之间通过肽键连接形成多肽，而多个多肽组成蛋白质。
氨基酸的侧链基团决定了其特性和功能。有些侧链基团带有电荷，可以在水中溶解，称为极性氨基酸，如谷氨酸、天冬氨酸等；有些侧链基团不带电荷，不易溶解在水中，称为非极性氨基酸，如丙氨酸、丝氨酸等。
多肽是由两个或多个氨基酸通过肽键连接而成的分子，可以是线性的，也可以是分枝的。多肽的长度不同，可以是几十个氨基酸，也可以是上千个氨基酸。
蛋白质是由一个或多个多肽组成的大分子，其结构可以分为四个层次：一级结构是由氨基酸线性排列而成的多肽链；二级结构是多肽链的局部折叠，形成α-螺旋、β-折叠等结构；三级结构是整个多肽链的折叠，形成一个功能完整的结构域；四级结构是由多个功能完整的结构域组装而成的整个蛋白质分子。
蛋白质的功能多种多样，包括催化反应、传递信息、结构支撑、运输分子等。不同的蛋白质结构和功能由其氨基酸序列和结构决定。
一般来说10个以内的氨基酸组成的多肽被称之为小肽，也就是2000道尔顿分子量以下；而50个氨基酸组成的称之为多肽，50个氨基酸组成的分子为蛋白质。
植物是利用离子和小分子的物质，经过光合作用，生产糖，再生产大分子的多糖（如纤维）和多肽及蛋白质；而动物则是利用多糖和蛋白质将其分解小分子的物质，产出能量和营养利用。
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